成立于2001年，是政府实施疾病预防控制与公共卫生技术管理和服务的公益事业单位,是云南省疾病预防控制及公共卫生技术管理指导中心。

　　截止2020年12月底，人员编制513人，现有在职职工460人，其中专业技术人员418人，高、中级职称占61.52%;本科以上学历占86.52%。中心内设机构30个。其中综合管理机构10个，业务机构20个。业务用房14184平方米，实验室面积5440平方米，拥有百级、万级和十万级净化实验室、生物安全三级实验室和动物房。可开展sars、新冠肺炎、高致病性禽流感、埃博拉出血热等病原微生物检测和理化、毒理学、微生物、临床检验等项目，2005年通过国家计量认证和实验室认可，2015年通过“iso9001质量管理体系"认证。

　　中心先后获得省(部)级以上资质31个。包括世界卫生组织认证或认可的合格脊髓灰质炎实验室、流感检测实验室、麻疹检测实验室;国家“两认"实验室、生物安全三级实验室、高致病性病原微生物实验室、食品安全定点检测机构、职业卫生技术服务机构甲级资质等国家认证实验室及资质。建设有“院士工作站"、“博士后工作站"， 云南省公共卫生执业(助理)医师国家医师资格考试实践技能考试基地，现为昆明医科大学、大理大学、海源学院等高校的教学实习基地。中心艾滋病防控创新团队入选省级研究创新团队，获批设立5个云南省医疗卫生单位内设研究机构，分别为云南省艾滋病研究所、云南省食品安全与营养研究中心、云南省麻风病研究中心、云南省肠道病毒研究中心和云南省结核病研究中心。分别承担 “十五"国家科技攻关项目，“十一五"、“十二五"、“十三五"国家科技重大专项项目。

　　先后获得全国卫生计生系统先进集体、全国“五一"劳动奖状、全国疾病预防控制先进集体、全国卫生应急先进集体、全国艾滋病防治工作先进集体、百家全国卫生系统思想政治工作先进单位、全国青年文明号、全国先进基层党组织、全国抗击新冠肺炎疫情先进集体等集体荣誉。中心职工也先后获得全国、云南省劳动模范、全国“三八"红旗手、“ 中国好医生"、云南省“五一劳动奖章"、“兴滇人才"、“云岭名医" 、“ 云南省三八红旗手"、 云南省优秀医疗卫生人员等荣誉称号。